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辉瑞2010年的研发投入达到94亿美元，比2009年的78亿美元增长了近20%。
辉瑞公司寄予厚望的新药包括今年年末有望被批准的非小细胞肺癌药物克唑替尼(crizotinib)，肾癌药物阿西替尼(axitinib)和慢性髓细胞样白血病药物伯舒替尼(bosutinib)。
去年12月，类风湿性关节炎药物蛋白酪氨酸激酶(JAK)抑制剂tasocitinib的Ⅲ期结果公布，该药可明显改善患者的疾病症状和机体功能。由于tasocitinib在缓解类风湿性关节炎症状方面具有显著疗效，因此有望成为辉瑞晚期新药中的一个“重磅炸弹”级产品。
另外，辉瑞与百时美施贵宝合作开发的apixiban在卒中预防研究中也表现出良好的疗效。辉瑞与Elan和强生合作开发的阿尔茨海默病药物bapineuzumab目前处于Ⅲ期临床研究阶段。
先前辉瑞计划于2012年将药物研发投入削减至80~85亿美元，最近又决定降至65~70亿美元。届时，辉瑞的药物研发投入将会位列罗氏、默沙东、诺华和强生之后的第五位。辉瑞研发投入的消减主要涉及到位于英国桑威治市的研发中心和美国康涅狄格州格罗顿的全球研发中心的泌尿、变态反应和RNA干涉(RNAi)研究方面的1000名研发职位裁减。不过，辉瑞将会加强公司在美国波士顿、旧金山和英国研究中心的研发能力。另外，辉瑞更加依赖外部合作资源，会加强与研发外包(CRO)公司的合作。
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