截至2020年10月,SARS-CoV-2导致了持续的大流行,全球报告的病例超过3500万,死亡人数超过100万。与SARS-CoV和A型流感病毒相比,在免疫反应方面将COVID-19与SARS区别开来的一个突出特征是SARS-CoV-2对I型干扰素(IFN)的诱导作用较差。值得注意的是,受损的IFN应答与COVID-19疾病有关。但是,在SARS-CoV-2感染中低效IFN反应的分子机制尚不清楚。
东京大学医学科学研究所(IMSUT)的一个研究小组旨在鉴定决定SARS-CoV-2感染后免疫激活的病毒因子,并发现由SARS-CoV-2编码的基因ORF3b是有效的IFN拮抗剂。
首席科学家,传染病控制部系统病毒学副教授Kei Sato说:“ COVID-19患者的IFN反应不良可能是由于这种病毒产物ORF3b的作用所致。”
尽管SARS-CoV感染会引起急性和严重的肺炎,但SARS-CoV-2感染可能是无症状的或导致类似流感的症状,例如发烧,咳嗽和疲劳。而且,与SARS-CoV和A型流感病毒感染相比,SARS-CoV-2感染的标志COVID-19是对I型干扰素(IFN)的不良诱导。值得注意的是,受损的IFN应答与COVID-19的严重程度有关。但是,在SARS-CoV-2感染中低效IFN反应的分子机制尚不清楚。
通过比较SARS-CoV-2编码基因和SARS-CoV的基因序列,研究小组发现SARS-CoV-2 ORF3b的基因长度明显短于SARS-CoV ORF3b的基因长度。
因为SARS-CoV的ORF3b被称为是抗IFN的病毒拮抗剂,所以他们假设SARS-CoV-2和SARS-CoV之间ORF3b基因长度的差异可能会改变其抗IFN活性,并可能进一步解释这一差异。这两种病毒感染的症状。
出乎意料的是,SARS-CoV-2 ORF3b是一种比SARS-CoV ORF3b更有效的IFN拮抗剂。系统发育分析和功能分析表明,蝙蝠和**甲的SARS-CoV-2相关病毒还编码具有较强抗IFN活性的较短的ORF3b基因产物。
具有增强的抗IFN活性的天然SARS-CoV-2 ORF3b变体的表征
此外,作者对大约17,000个SARS-CoV-2序列的分析确定了一个自然变异,其中重构了更长的ORF3b阅读框。该变体比亲本SARS-CoV-2株的ORF3b更有效地抑制IFN。
因此,继续监测病毒序列以查看在当前的大流行期间是否出现新的ORF3b突变将很重要。(生物谷 Bioon.com)
资讯出处:Identification of a viral factor that impairs immune responses in COVID-19 patients
原始出处:Yoriyuki Konno, Izumi Kimura, Keiya Uriu, Masaya Fukushi, Takashi Irie, Yoshio Koyanagi, Daniel Sauter, Robert J. Gifford, So Nakagawa, Kei Sato. SARS-CoV-2 ORF3b Is a Potent Interferon Antagonist Whose Activity Is Increased by a Naturally Occurring Elongation Variant. Cell Reports, 2020; 32 (12): 108185 DOI: 10.1016/j.celrep.2020.108185
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擅长领域:肺部感染性疾病的诊治。
擅长领域:内一科(感染性疾病科)主任,主任医师。毕业于内蒙古医科大学,大学本科学历,从事临床工作近三十年,多次主持科室急、危、重症病例的抢救工作,擅长传染科常见病、多发病诊疗,皮肤病诊疗。对各种病毒性肝炎、黄疸、酒精性肝病、药物性肝损伤、肝硬化腹水、上消化道出血、肝性脑病、肺结核并发咯血、麻疹、水痘、流行性腮腺炎及其并发症、猩红热、风疹、手足口病、细菌性痢疾、感染性腹泻、流感、梅毒等疾病有丰富的临床诊治经验。
擅长领域:儿童血液病如白血病、再生障碍性贫血、地中海贫血的、特发性血小板减少性紫癜等疾病的诊治;儿童呼吸系统及消化系统疾病。